Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EgfrQ01279 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
EgfrQ01279 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EgfrQ01279 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EgfrQ01279 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EgfrQ01279 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EgfrQ01279 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EgfrQ01279 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EgfrQ01279 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EgfrQ01279 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EgfrQ01279 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EgfrQ01279 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EgfrQ01279 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EgfrQ01279 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EgfrQ01279 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EgfrQ01279 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EgfrQ01279 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EgfrQ01279 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EgfrQ01279 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EgfrQ01279 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EgfrQ01279 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EgfrQ01279 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EgfrQ01279 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EgfrQ01279 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EgfrQ01279 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
EgfrQ01279 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EgfrQ01279 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EgfrQ01279 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EgfrQ01279 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EgfrQ01279 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EgfrQ01279 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EgfrQ01279 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EgfrQ01279 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EgfrQ01279 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EgfrQ01279 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms