Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp1Q00915 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp1Q00915 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp1Q00915 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp1Q00915 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbp1Q00915 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp1Q00915 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbp1Q00915 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbp1Q00915 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbp1Q00915 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbp1Q00915 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbp1Q00915 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbp1Q00915 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms