Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf7Q00417 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf7Q00417 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf7Q00417 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcf7Q00417 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcf7Q00417 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcf7Q00417 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms