Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmb4P99026 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmb4P99026 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmb4P99026 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmb4P99026 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmb4P99026 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmb4P99026 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psmb4P99026 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmb4P99026 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmb4P99026 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmb4P99026 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmb4P99026 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmb4P99026 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmb4P99026 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmb4P99026 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmb4P99026 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmb4P99026 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmb4P99026 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmb4P99026 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms