Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra1P97785 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfra1P97785 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra1P97785 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra1P97785 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra1P97785 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gfra1P97785 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms