Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Thumpd3P97770 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thumpd3P97770 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thumpd3P97770 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thumpd3P97770 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thumpd3P97770 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd3P97770 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd3P97770 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thumpd3P97770 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Thumpd3P97770 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thumpd3P97770 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thumpd3P97770 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thumpd3P97770 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms