Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Crmp1P97427 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Crmp1P97427 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crmp1P97427 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crmp1P97427 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crmp1P97427 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crmp1P97427 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crmp1P97427 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crmp1P97427 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crmp1P97427 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crmp1P97427 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crmp1P97427 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crmp1P97427 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Crmp1P97427 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crmp1P97427 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crmp1P97427 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crmp1P97427 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crmp1P97427 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms