Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HpcaP84075 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HpcaP84075 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HpcaP84075 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HpcaP84075 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HpcaP84075 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HpcaP84075 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HpcaP84075 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpcaP84075 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpcaP84075 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpcaP84075 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HpcaP84075 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpcaP84075 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms