Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TgfbiP82198 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TgfbiP82198 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TgfbiP82198 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TgfbiP82198 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TgfbiP82198 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TgfbiP82198 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TgfbiP82198 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TgfbiP82198 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TgfbiP82198 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TgfbiP82198 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TgfbiP82198 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgfbiP82198 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TgfbiP82198 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TgfbiP82198 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms