Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Q6P79568 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q6P79568 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q6P79568 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q6P79568 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q6P79568 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q6P79568 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q6P79568 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-Q6P79568 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-Q6P79568 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Q6P79568 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms