Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ext2P70428 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ext2P70428 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ext2P70428 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ext2P70428 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ext2P70428 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ext2P70428 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ext2P70428 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ext2P70428 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ext2P70428 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ext2P70428 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ext2P70428 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ext2P70428 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ext2P70428 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ext2P70428 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ext2P70428 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ext2P70428 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ext2P70428 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ext2P70428 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ext2P70428 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ext2P70428 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms