Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad1P70340 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smad1P70340 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad1P70340 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smad1P70340 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smad1P70340 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smad1P70340 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad1P70340 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad1P70340 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smad1P70340 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smad1P70340 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smad1P70340 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smad1P70340 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smad1P70340 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad1P70340 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad1P70340 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad1P70340 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad1P70340 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms