Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntn5P68500 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cntn5P68500 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntn5P68500 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntn5P68500 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntn5P68500 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntn5P68500 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntn5P68500 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntn5P68500 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntn5P68500 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cntn5P68500 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn5P68500 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn5P68500 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntn5P68500 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms