Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Crip1P63254 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Crip1P63254 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Crip1P63254 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Crip1P63254 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Crip1P63254 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Crip1P63254 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Crip1P63254 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Crip1P63254 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crip1P63254 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crip1P63254 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Crip1P63254 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Crip1P63254 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Crip1P63254 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crip1P63254 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crip1P63254 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Crip1P63254 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Crip1P63254 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Crip1P63254 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Crip1P63254 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Crip1P63254 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Crip1P63254 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip1P63254 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crip1P63254 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crip1P63254 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crip1P63254 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crip1P63254 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crip1P63254 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crip1P63254 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crip1P63254 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms