Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpd2P62317 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpd2P62317 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snrpd2P62317 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snrpd2P62317 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpd2P62317 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms