Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tspan5P62080 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan5P62080 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan5P62080 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan5P62080 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan5P62080 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tspan5P62080 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan5P62080 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan5P62080 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan5P62080 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan5P62080 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan5P62080 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms