Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Ap1s1P61967 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ap1s1P61967 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ap1s1P61967 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ap1s1P61967 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ap1s1P61967 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ap1s1P61967 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ap1s1P61967 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ap1s1P61967 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ap1s1P61967 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Ap1s1P61967 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ap1s1P61967 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ap1s1P61967 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ap1s1P61967 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ap1s1P61967 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ap1s1P61967 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ap1s1P61967 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ap1s1P61967 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,55
Ap1s1P61967 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ap1s1P61967 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ap1s1P61967 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ap1s1P61967 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ap1s1P61967 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ap1s1P61967 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ap1s1P61967 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ap1s1P61967 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,1 ms