Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ufm1P61961 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufm1P61961 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ufm1P61961 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufm1P61961 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ufm1P61961 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufm1P61961 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufm1P61961 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms