Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copz1P61924 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copz1P61924 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copz1P61924 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copz1P61924 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copz1P61924 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copz1P61924 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copz1P61924 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copz1P61924 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copz1P61924 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copz1P61924 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copz1P61924 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copz1P61924 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Copz1P61924 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copz1P61924 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copz1P61924 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copz1P61924 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copz1P61924 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copz1P61924 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copz1P61924 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms