Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stx1bP61264 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1bP61264 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1bP61264 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1bP61264 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx1bP61264 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1bP61264 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx1bP61264 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx1bP61264 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1bP61264 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1bP61264 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1bP61264 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx1bP61264 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms