Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl8P59280 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl8P59280 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl8P59280 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl8P59280 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl8P59280 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms