Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpm2P58774 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tpm2P58774 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpm2P58774 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tpm2P58774 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpm2P58774 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpm2P58774 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpm2P58774 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpm2P58774 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpm2P58774 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm2P58774 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm2P58774 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm2P58774 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm2P58774 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpm2P58774 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpm2P58774 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm2P58774 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm2P58774 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm2P58774 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tpm2P58774 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpm2P58774 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm2P58774 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm2P58774 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm2P58774 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm2P58774 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm2P58774 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpm2P58774 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tpm2P58774 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm2P58774 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm2P58774 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm2P58774 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm2P58774 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm2P58774 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms