Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp1P58466 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp1P58466 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp1P58466 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctdsp1P58466 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdsp1P58466 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms