Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtdsplP58465 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtdsplP58465 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtdsplP58465 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtdsplP58465 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtdsplP58465 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtdsplP58465 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CtdsplP58465 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtdsplP58465 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtdsplP58465 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtdsplP58465 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CtdsplP58465 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtdsplP58465 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtdsplP58465 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtdsplP58465 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtdsplP58465 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtdsplP58465 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtdsplP58465 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtdsplP58465 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtdsplP58465 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtdsplP58465 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtdsplP58465 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtdsplP58465 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtdsplP58465 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtdsplP58465 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtdsplP58465 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms