Protein–RNA interactions for Protein: P58406

Hrh3, Histamine H3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh3P58406 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hrh3P58406 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hrh3P58406 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hrh3P58406 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hrh3P58406 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hrh3P58406 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hrh3P58406 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms