Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp1P55194 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3bp1P55194 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp1P55194 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1P55194 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp1P55194 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3bp1P55194 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp1P55194 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms