Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pms2P54279 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pms2P54279 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pms2P54279 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pms2P54279 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pms2P54279 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pms2P54279 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pms2P54279 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pms2P54279 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pms2P54279 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pms2P54279 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pms2P54279 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pms2P54279 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pms2P54279 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pms2P54279 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pms2P54279 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pms2P54279 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pms2P54279 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pms2P54279 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pms2P54279 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pms2P54279 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pms2P54279 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pms2P54279 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pms2P54279 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pms2P54279 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pms2P54279 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pms2P54279 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pms2P54279 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pms2P54279 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pms2P54279 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pms2P54279 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pms2P54279 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pms2P54279 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pms2P54279 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms