Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClgnP52194 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClgnP52194 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClgnP52194 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ClgnP52194 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClgnP52194 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClgnP52194 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClgnP52194 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClgnP52194 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ClgnP52194 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ClgnP52194 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClgnP52194 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClgnP52194 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ClgnP52194 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ClgnP52194 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClgnP52194 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ClgnP52194 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ClgnP52194 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ClgnP52194 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ClgnP52194 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClgnP52194 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ClgnP52194 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ClgnP52194 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClgnP52194 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClgnP52194 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClgnP52194 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClgnP52194 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClgnP52194 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClgnP52194 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ClgnP52194 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClgnP52194 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClgnP52194 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClgnP52194 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClgnP52194 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ClgnP52194 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClgnP52194 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClgnP52194 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClgnP52194 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClgnP52194 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ClgnP52194 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ClgnP52194 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClgnP52194 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClgnP52194 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClgnP52194 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms