Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccl9P51670 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccl9P51670 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccl9P51670 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl9P51670 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl9P51670 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl9P51670 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl9P51670 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl9P51670 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl9P51670 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl9P51670 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl9P51670 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl9P51670 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl9P51670 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl9P51670 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl9P51670 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl9P51670 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl9P51670 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl9P51670 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl9P51670 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccl9P51670 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccl9P51670 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl9P51670 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl9P51670 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl9P51670 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl9P51670 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms