Protein–RNA interactions for Protein: P51637

Cav3, Caveolin-3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav3P51637 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav3P51637 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav3P51637 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav3P51637 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav3P51637 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav3P51637 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cav3P51637 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cav3P51637 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav3P51637 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav3P51637 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav3P51637 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cav3P51637 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cav3P51637 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cav3P51637 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cav3P51637 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cav3P51637 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cav3P51637 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cav3P51637 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cav3P51637 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cav3P51637 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cav3P51637 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cav3P51637 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cav3P51637 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cav3P51637 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav3P51637 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav3P51637 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav3P51637 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav3P51637 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav3P51637 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav3P51637 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cav3P51637 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav3P51637 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav3P51637 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav3P51637 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms