Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LtbrP50284 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LtbrP50284 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LtbrP50284 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LtbrP50284 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LtbrP50284 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LtbrP50284 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LtbrP50284 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LtbrP50284 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LtbrP50284 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LtbrP50284 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LtbrP50284 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LtbrP50284 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LtbrP50284 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LtbrP50284 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LtbrP50284 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LtbrP50284 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LtbrP50284 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LtbrP50284 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LtbrP50284 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LtbrP50284 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LtbrP50284 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LtbrP50284 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LtbrP50284 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LtbrP50284 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LtbrP50284 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LtbrP50284 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LtbrP50284 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LtbrP50284 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LtbrP50284 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LtbrP50284 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LtbrP50284 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LtbrP50284 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LtbrP50284 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LtbrP50284 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LtbrP50284 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LtbrP50284 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LtbrP50284 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LtbrP50284 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LtbrP50284 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LtbrP50284 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LtbrP50284 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LtbrP50284 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LtbrP50284 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LtbrP50284 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LtbrP50284 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LtbrP50284 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LtbrP50284 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms