Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl5P50228 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl5P50228 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl5P50228 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcl5P50228 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcl5P50228 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcl5P50228 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms