Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scg3P47867 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scg3P47867 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scg3P47867 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scg3P47867 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scg3P47867 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scg3P47867 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scg3P47867 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scg3P47867 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Scg3P47867 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg3P47867 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg3P47867 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg3P47867 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg3P47867 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scg3P47867 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg3P47867 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg3P47867 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg3P47867 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scg3P47867 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scg3P47867 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scg3P47867 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg3P47867 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms