Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnr1P47746 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnr1P47746 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnr1P47746 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnr1P47746 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnr1P47746 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnr1P47746 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnr1P47746 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnr1P47746 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnr1P47746 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnr1P47746 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnr1P47746 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnr1P47746 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnr1P47746 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnr1P47746 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnr1P47746 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnr1P47746 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnr1P47746 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnr1P47746 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnr1P47746 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms