Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pax9P47242 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax9P47242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax9P47242 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax9P47242 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax9P47242 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax9P47242 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax9P47242 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax9P47242 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pax9P47242 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax9P47242 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax9P47242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pax9P47242 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax9P47242 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax9P47242 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax9P47242 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pax9P47242 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pax9P47242 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pax9P47242 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms