Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps4bP46467 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps4bP46467 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps4bP46467 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps4bP46467 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps4bP46467 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms