Protein–RNA interactions for Protein: P42932

Cct8, T-complex protein 1 subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8P42932 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cct8P42932 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cct8P42932 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cct8P42932 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cct8P42932 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cct8P42932 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cct8P42932 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cct8P42932 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cct8P42932 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cct8P42932 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cct8P42932 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cct8P42932 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8P42932 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct8P42932 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8P42932 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8P42932 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cct8P42932 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cct8P42932 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms