Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh4P39038 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh4P39038 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh4P39038 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh4P39038 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh4P39038 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh4P39038 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh4P39038 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms