Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sar1aP36536 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sar1aP36536 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sar1aP36536 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sar1aP36536 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sar1aP36536 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sar1aP36536 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sar1aP36536 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sar1aP36536 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sar1aP36536 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sar1aP36536 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sar1aP36536 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sar1aP36536 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sar1aP36536 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sar1aP36536 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sar1aP36536 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1aP36536 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sar1aP36536 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sar1aP36536 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sar1aP36536 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sar1aP36536 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sar1aP36536 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sar1aP36536 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1aP36536 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sar1aP36536 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sar1aP36536 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms