Protein–RNA interactions for Protein: P35831

Ptpn12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn12P35831 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ptpn12P35831 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ptpn12P35831 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ptpn12P35831 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ptpn12P35831 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ptpn12P35831 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ptpn12P35831 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ptpn12P35831 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ptpn12P35831 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ptpn12P35831 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ptpn12P35831 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ptpn12P35831 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ptpn12P35831 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ptpn12P35831 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ptpn12P35831 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ptpn12P35831 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ptpn12P35831 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ptpn12P35831 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ptpn12P35831 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ptpn12P35831 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ptpn12P35831 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ptpn12P35831 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ptpn12P35831 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ptpn12P35831 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ptpn12P35831 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ptpn12P35831 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpn12P35831 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ptpn12P35831 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ptpn12P35831 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptpn12P35831 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ptpn12P35831 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ptpn12P35831 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpn12P35831 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpn12P35831 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpn12P35831 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpn12P35831 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptpn12P35831 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptpn12P35831 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms