Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab20P35295 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab20P35295 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab20P35295 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab20P35295 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab20P35295 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab20P35295 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab20P35295 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab20P35295 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab20P35295 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab20P35295 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab20P35295 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab20P35295 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab20P35295 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rab20P35295 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab20P35295 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab20P35295 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab20P35295 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab20P35295 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab20P35295 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab20P35295 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab20P35295 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab20P35295 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab20P35295 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab20P35295 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms