Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab17P35292 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab17P35292 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab17P35292 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab17P35292 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab17P35292 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab17P35292 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab17P35292 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab17P35292 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab17P35292 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab17P35292 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab17P35292 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab17P35292 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab17P35292 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab17P35292 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab17P35292 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab17P35292 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab17P35292 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab17P35292 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab17P35292 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab17P35292 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab17P35292 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab17P35292 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rab17P35292 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms