Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Apoc1P34928 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoc1P34928 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoc1P34928 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoc1P34928 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoc1P34928 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoc1P34928 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apoc1P34928 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoc1P34928 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoc1P34928 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoc1P34928 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apoc1P34928 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoc1P34928 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apoc1P34928 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoc1P34928 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoc1P34928 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoc1P34928 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc1P34928 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc1P34928 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms