Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfap2aP34056 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfap2aP34056 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfap2aP34056 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap2aP34056 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap2aP34056 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfap2aP34056 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms