Protein–RNA interactions for Protein: P33174

Kif4, Chromosome-associated kinesin KIF4, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif4P33174 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kif4P33174 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kif4P33174 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kif4P33174 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kif4P33174 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kif4P33174 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kif4P33174 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kif4P33174 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif4P33174 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif4P33174 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif4P33174 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Kif4P33174 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kif4P33174 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kif4P33174 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kif4P33174 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kif4P33174 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kif4P33174 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kif4P33174 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kif4P33174 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kif4P33174 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif4P33174 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif4P33174 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kif4P33174 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kif4P33174 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif4P33174 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif4P33174 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kif4P33174 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kif4P33174 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kif4P33174 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kif4P33174 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kif4P33174 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kif4P33174 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif4P33174 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif4P33174 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kif4P33174 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms