Protein–RNA interactions for Protein: P31650

Slc6a11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a11P31650 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a11P31650 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a11P31650 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a11P31650 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc6a11P31650 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc6a11P31650 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a11P31650 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms