Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa2P31245 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa2P31245 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa2P31245 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa2P31245 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa2P31245 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa2P31245 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa2P31245 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa2P31245 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa2P31245 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa2P31245 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa2P31245 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxa2P31245 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa2P31245 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa2P31245 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms