Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RxrbP28704 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RxrbP28704 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RxrbP28704 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RxrbP28704 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RxrbP28704 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RxrbP28704 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RxrbP28704 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RxrbP28704 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RxrbP28704 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RxrbP28704 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RxrbP28704 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RxrbP28704 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RxrbP28704 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RxrbP28704 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RxrbP28704 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RxrbP28704 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RxrbP28704 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RxrbP28704 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RxrbP28704 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RxrbP28704 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RxrbP28704 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RxrbP28704 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RxrbP28704 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RxrbP28704 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RxrbP28704 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RxrbP28704 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RxrbP28704 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RxrbP28704 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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