Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dusp1P28563 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp1P28563 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp1P28563 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp1P28563 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp1P28563 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp1P28563 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp1P28563 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp1P28563 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp1P28563 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp1P28563 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp1P28563 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp1P28563 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp1P28563 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dusp1P28563 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp1P28563 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp1P28563 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dusp1P28563 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms