Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vav1P27870 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vav1P27870 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vav1P27870 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vav1P27870 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vav1P27870 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vav1P27870 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vav1P27870 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vav1P27870 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vav1P27870 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vav1P27870 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vav1P27870 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vav1P27870 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vav1P27870 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vav1P27870 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vav1P27870 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vav1P27870 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vav1P27870 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vav1P27870 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vav1P27870 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vav1P27870 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vav1P27870 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vav1P27870 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vav1P27870 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms